Bereits mit 27 Jahren beendete Uli Hoeneß aufgrund chronischer Kniebeschwerden seine Karriere beim 1. FC Nürnberg. Er wurde anschließend als Jüngster in der Bundesliga Manager des FC Bayern München. Zu dieser Zeit hatte der Verein einen Umsatz von 6 Mio. € und 3,5 Mio. € Schulden und die letzte Meisterschaft lag bereits fünf Jahre zurück. Hoeneß genießt nicht nur ein Ansehen als Topmanager, er ist auch für seine Hilfs- und Spendenbereitschaft deutschlandweit bekannt.

Er ist Gesellschafter der HoWe Wurstwaren KG in Nürnberg, wobei HoWe für Hoeneß und Weiß steht. Dies ist auch der Grund für seinen Spitznamen Würstchen-Uli. Die Firma (gegründet 1983) wird von seinem Sohn Florian als Geschäftsführer geleitet. Beliefert werden unter anderem Aldi und das Bierzelt von Feinkost Käfer auf dem Münchner Oktoberfest sowie zahlreiche andere Lebensmittelkonzerne in ganz Europa.

Hoeneß als Manager ist maßgeblich für den geschäftlichen Erfolg der FC Bayern München AG verantwortlich. Er wohnt mit seiner Frau in Bad Wiessee am Tegernsee, rund 50 km südlich von München.